Дія Singularity стартує 2010-го року. Головна роль віддана пілоту військово-повітряних сил США Нейту Ренко (Nate Renko), якому псують місію злітати на таємничий острів, що належить колись СРСР, звідки почали надходити якісь загадкові сигнали. Після прибуття на місце йому відкриється страшна правда — російські розробляли тут у часи «Холодної Війни» секретну зброю під назвою Element 99 і спеціальний пристрій для керування часом Time Manipulation Device (TMD). Як не важко здогадатися, фундамент геймплею — це перемотування часу назад/вперед, уповільнення та інші радощі життя. Але Singularity піде навіть трохи далі ГОСТу — відмотувати час можна не на десять-п'ятнадцять секунд, а на сотні років уперед. Ось тут і відкривається простір для фантазії — наприклад, міст, яким прогулюються вороги, можна перетворити на пил лише за кілька секунд. Для вас це буде одна мить, а для моста — кілька сотень років. Інше застосування — перетворювати розгулювальний спецназ на білі скелети (у буквальному сенсі), просто старівши їх років на сто-двіття. Але острів і сам часто грає з часом. Нашого героя регулярно закидатимуть у 50-і роки минулого століття, коли на острові ще кипило життя. Завдяки таким флешбекам поступово буде розповідатися про сутність Element 99 і розкриватися підоплека основних подій.