Command&Conquer: Red Alert 3 — це продовження "клюкваної" стратегії в реальному часі, у якій стикаються в протистоянні СРСР, США та Японська імперія. Події гри розгортаються відразу ж після закінчення другої частини — після ураження Радянського Союзу від рук союзників російські вирішують знищити Альберта Ейнштейна в минулому, оскільки саме він зробив вирішальний внесок у технічну міць альянсу. нно-близнюка, найближчий соратник прем'єра Романова, потрапляє в минуле, привівши в дію машину часу, секретний проєкт Союзу. Авантюра вдається, і СРСР захоплює половину Європи в зміненому справжньому, проте удар наноситься звідти, де його ніхто не чекав — зі сходу СРСР атакує Імперія Сходнього сонця. Гравцям належить взяти участь у трьох кампаніях за кожну зі сторін конфлікту, щоб визначити результат Тертією Світової війни.