Главным героем Scars of the War является Уолтер Фенг, солдат армии Соединённых Штатов Нового Континента (USN). Повествование затрагивает несколько десятилетий его жизни с 2070 года по 2121-й. Протагонист участвует в различных военных конфликтах, некоторые из которых уже имели место быть в предыдущих частях серии, и пытается разыскать своего друга Глена Дюваля, однажды присоединившегося к Океаническому Объединённому Союзу (OCU).