События начинаются с того, что главный герой Джеймс получает письмо от... умершей несколько лет назад жены. В котором она "пишет", чтобы он вернулся к ней в Silent Hill, город, где они были однажды на курорте. Однако самое странное не это, а тот факт, что Джеймс не бросил эту абсурдную идею, и действительно приехал. Зачем? Что заставило его поверить в этот абсурд? С этого и начинается то концептуальное отличие, о котором говорилось выше.

Игровой процесс состоит из исследования туманного городка Silent Hill. С видом от третьего лица вы бродите по доступным локациям и пытаетесь найти разгадку таинственного письма. Однако со временем эта цель немного уходит на второй план, и вас начинает интересовать природа событий, творящихся вокруг. Во-первых, стоит ли говорить, что город полон монстров. С ними придется сталкиваться на протяжении всей игры. Вы будете постепенно накапливать в своем инвентаре арсенал холодного и огнестрельного оружия, как то: стартовая палка с гвоздем на конце (на легком уровне сложности доступна бензопила), пистолет, дробовик, etc.